StrategickéPříběh Aftershock navazuje na jeden z alternativních konců prvního dílu, kde byla země přenechána mimozemským vědcům jenž chtějí ze Země udělat jeden obrovský žijící organismus. Zemská rada a její příznivci se poté usadili na obíhajícím satelitu.
Příběh Aftershock navazuje na jeden z alternativních konců prvního dílu, kde byla země přenechána mimozemským vědcům jenž chtějí ze Země udělat jeden obrovský žijící organismus. Zemská rada a její příznivci se poté usadili na obíhajícím satelitu. Ne všichni se ale chtěli vzdát své rodné země a nechtěli se odstěhovat na mimozemšťany připravený satelit. Děj hry začíná v momentě, kdy část lidstva žije na satelitu. Není sice známka o nějaké mimozemské přítomnosti, ale zároveň nemají žádné zprávy o tom, co se děje na Zemi.
Musíte se tak na naší planetu vypravit a zjistit okolnosti událostí a jak se daří lidem, kteří na Zemi zůstali. Pokračování hry nabízí celou řadu novinek a vylepšení. Asi největší novinkou je implementace budování a správy základny a surovin, což bylo zbožné přání hráčů již v prvním díle hry. Dále se můžete těšit na nové druhy nepřátel, zbraní, vylepšený soubojový systém a sousta nových technologií k prozkoumání.