Palírna Tomatin byla založena v r. 1897 skupinou podnikatelů z Inverness sdružených v The Tomatin-Spey District-Distillery Co. V r. 1906 tato společnost zbankrotovala, ale již v r. 1909 vznikla Tomatin Distillers Co Ltd a obnovila provoz palírny. V letech 1956-1974 prošla palírna několika rekonstrukcemi, které z ní udělaly největší skotskou palírnu whisky.